一,、案例介紹
下圖數(shù)據(jù)為A基因和B基因的表達(dá)量（范例數(shù)據(jù)為隨機(jī)數(shù)據(jù),，無生物學(xué)意義），根據(jù)數(shù)據(jù)作基因表達(dá)相關(guān)性散點(diǎn)圖,。
二,、軟件操作方法
1、打開Graphpad Prism軟件,，圖表類型選擇“XY”,，勾選“Enter and plot a single Y value for each point”，點(diǎn)擊“Creat”創(chuàng)建新圖表,。（圖1）
圖1 創(chuàng)建XY圖表
2,、寫入/導(dǎo)入數(shù)據(jù)（圖2）。
圖2 數(shù)據(jù)錄入
3,、找到Graphs（圖3）,，點(diǎn)擊以上數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的名稱，就可生成圖形,。
圖3 生成圖形
4,、點(diǎn)擊Analysis中的“Fit a line with the linear regression”，對(duì)線性回歸的數(shù)據(jù)和參數(shù)進(jìn)行設(shè)置,。一般不需要做任何個(gè)性化設(shè)置,，點(diǎn)擊OK后即可獲得A基因和B基因的相關(guān)性趨勢(shì)曲線。（圖4）
圖4-1 添加相關(guān)性趨勢(shì)線
圖4-2 添加相關(guān)性趨勢(shì)線
圖4-3 添加相關(guān)性趨勢(shì)線
5,、查看統(tǒng)計(jì)結(jié)果：點(diǎn)擊“Result”選擇中“Linear reg. of data 1”,，R2和P值（圖5），分別代表數(shù)據(jù)的線性情況和顯著性,。其中：r為相關(guān)性系數(shù),，r的值介于+1和-1之間，其絕對(duì)值越靠近1說明相關(guān)性越強(qiáng),，正負(fù)表示相關(guān)的方向,，正值說明為正相關(guān)，負(fù)值說明為負(fù)相關(guān),。
圖5 查看統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果
6,、圖形調(diào)整與優(yōu)化：（1）調(diào)整命名，可選擇刪除Data1、X title和Y title標(biāo)題,，重新命名,；（2）可以利用change版塊調(diào)整圖片，也可以直接雙擊圖形/坐標(biāo)軸修改圖片大小,、顏色,、X軸Y軸等信息；（3）繪制好的圖形中添加R2和P值,。（圖6）
圖6 圖形優(yōu)化
