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GraphPad Prism繪制熱圖

發(fā)布日期:2025-01-20     點擊數(shù):次

一,、案例數(shù)據(jù)

熱圖(Heatmaps)是將數(shù)據(jù)矩陣中的各個值按一定規(guī)律映射為顏色來進(jìn)行展示,利用顏色變化實現(xiàn)數(shù)據(jù)的可視化,。通過熱圖,,我們可以快速地了解數(shù)據(jù)的分布規(guī)律、熱點區(qū)域以及密度變化情況,,為圖像分析提供直觀的參考依據(jù),。根據(jù)下列范例數(shù)據(jù)(范例數(shù)據(jù)為隨機數(shù)據(jù),無生物學(xué)意義),,利用GraphPad Prism軟件繪制熱圖,。

二、軟件操作方法

1,、圖表選項

1.1 打開Graphpad Prism軟件,圖表類型選擇“Grouped”,;

1.2 勾選“Enterorimport data into a new table”,;

1.3 Options選擇“Enter and plot a single Y value for each point”;

1.4 點擊“Creat”創(chuàng)建新圖表,。(圖1)

圖1 創(chuàng)建圖表

2,、寫入/導(dǎo)入數(shù)據(jù)(圖2),。

圖2 數(shù)據(jù)錄入

3、在左側(cè)項目列表中Graphs處選擇Date 1,,圖表類型選擇“Heat Map”,,并在其中選擇一種配色方案,即可初步得到繪制的熱圖,。(圖3)

圖3 生成曲線圖形

4,、圖形調(diào)整與優(yōu)化:

4.1 顏色設(shè)置:雙擊繪圖區(qū)域,打開Format Graph窗口,,在Color mapping選項卡下,,修改Colormap為“Doublegradient”,在Range選項下可修改顏色范圍,,也可自定義最小值和最大值,。(圖4-1)

圖4-1 熱圖顏色修改

4.2 坐標(biāo)設(shè)置:在Format Graph窗口中點擊“Labels”,“Row Labels”中修改橫坐標(biāo)標(biāo)簽信息,,Mark選項選擇“Every”,,可以在“Font”中修改字體;“Column Labels”修改如同“Row Labels”,。修改后點擊“Apply”,。(圖4-2)

圖4-2 橫縱坐標(biāo)標(biāo)簽信息修改

4.3 熱圖邊框修改:切換至Graph Settings選項卡,修改Heatmap borders的粗細(xì)為“1 pt”,,即熱圖邊框的粗細(xì),,也可修改顏色。勾選“Cell borders”可顯示每個單元格的邊框,,如圖4-3,。

圖4-3 熱圖邊框修改

4.4 顯示坐標(biāo)標(biāo)題:切換至“Titles”選項卡,勾選“Show row labels title”和“Show column labels title”即可,。(圖4-4)

圖4-4 熱圖坐標(biāo)標(biāo)題修改

5 若需要對熱圖添加間隙,,可打開Format Graph窗口,點擊Gaps選項,,對“Vertical gaps”和“Horizontal gaps”進(jìn)行編輯,,比如我們需要橫向和縱向都進(jìn)行分組,可以如圖5進(jìn)行設(shè)置,。

圖5 熱圖添加間隙設(shè)置

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